培养基可分为一类和二类，一类包括基础培养基、营养培养基和通用增菌培养基，二类包括药敏试验用培养基和/选择增菌培养基。根据细菌的营养要求加入适当的生长因子或微量元素等。如碱性蛋白胨水培养基等，在取样后和样品处理前保护和维持微生物活性。将混有多种细菌的标本经培养而分离成单个菌落并能从中将目的菌检出。主要根据目的菌生长繁殖需要，在基础培养基中加入适量特殊营养成分或生长因子，或加入选择性抑制剂，达到提高目的菌检出率的目的。
这些培养基该如何贮藏呢？
自配的培养基应标记名称、批号、配制日期、制备人等信息，并在已验证的条件下贮藏。商品化的成品标签上应标有名称、批号、生产日期、失效期及有关特性，生产商和使用者应根据使用说明书上的要求进行贮藏，所采用的贮藏和运输条件应使成品培养基低限度的失去水分并提供机械保护。培养基灭菌后不得贮藏在髙压灭菌器中，琼脂培养基不得在0℃或0℃以下存放，因为冷冻可能破坏凝胶特性。保存应防止水分流失，避光保存。琼脂平板要现配现用，如置冰箱保存，一般不超过1周，且应密闭包装，若延长保存期限，保存期需经验证确定。固体培养基灭菌后只允许1次再融化，避免因过度受热造成培养基质量下降或微生物污染。培养基的再融化一般采用水浴或流通蒸汽加热，若采用其他溶解方法，应对其进行评估，确认该溶解方法不影响质量。融化的培养基应置于45-50℃的环境中，不得超过8小时。使用过的培养基(包括失效的）应按照国家污染废物处理相关规定进行。
