可先用50％乙醇煮沸1小时，再依次用50％乙醇、0.01mol/L碳酸氢钠和0.001mol/LEDTA溶液洗涤，用蒸馏水冲洗即可使用。实验证明，50％乙醇处理对除去具有紫外吸收的杂质特别有效。（也可先在大体积的2%（W/V）碳酸氢钠和1mmol/LEDTA（pH8.0）中，将
透析袋煮沸10分钟，用蒸馏水*清洗后，再放在1mmol/LEDTA（pH8.0）中将之煮沸10分钟。）
新的透析袋如不作如上的特殊处理，则可用沸水煮五至十分钟，再用蒸馏水洗净，即可使用。使用时一端用橡皮筋或线绳扎紧，也可以使用特制的透析袋夹夹紧，由另一端灌满水，用手指稍加压，检查不漏，方可装入待透析液，通常要留三分之一至一半的空间，以防透析过程中，透析的小分子量较大时，袋外的水和缓冲液过量进入袋内将袋涨破。含盐量很高的蛋白质溶液透析过夜时，体积增加50％是正常的。为了加快透析速度，除多次更换透析液外，还可使用磁子搅拌。透析的容器要大一些，可以使用大烧杯、大量筒和塑料桶。小量体积溶液的透析，可在袋内放一截两头烧园的玻璃棒或两端封口的玻璃管，以使透析袋沉入液面以下。
使用后的透析袋洗净后可存于4℃蒸馏水中，确保透析袋始终浸没在溶液内。若长时间不用，可加少量NaN2，以防长菌。从此时起取用透析袋必须戴手套。洗净凉干的透析袋弯折时易裂口，用时必须仔细检查，不漏时方可重复使用。在保持之前需用生理盐水浸泡以去掉蛋白，并用蒸馏水清洗干净，然后置50％乙醇中保存即可；用完以后,要*洗干净,透析袋也可以保存在0.1%叠氮钠（可防止微生物生长）里；0.05%-0.1%叠氮钠，或者1mMEDTA，或者50％甘油中4度保存。
